Бернер има дипломи от Химикотехнологичния и металургичен университет в София и Националния военен университет „Васил Левски“ във Велико Търново
Министър-председателят Бойко Борисов назначи Милко Бернер за заместник-министър за вътрешните работи.
Милко Бернер е завършил Химикотехнологичния и металургичен университет в София и Националния военен университет "Васил Левски" във Велико Търново.
В периода февруари – август 2002 г. е бил старши национален представител и командир на първия български контингент в състава на ISAF в Кабул – Афганистан. Заемал е длъжността заместник-началник на
отдел прилагане на Конвенцията за забрана на химическото оръжие в Генералния щаб на Българската армия от 2000 до 2006 г.
